Původně románský kostel pochází z let 1178–1187. Během josefínských reforem byl kostel zrušen, prodán a využíván postupně jako skladiště, byty či obchody. Na počátku 20. století jej odkoupila a nechala obnovit Pražská obec.
Po první světové válce získala kostel do dlouhodobého proájmu Českobratrská církev evangelická.
Kostel je v současnosti využíván pro pravidelná i nepravidelná bohoslužebná shromáždění, mezi než patří i svatby či pohřby, a dále také pro koncerty a výstavy.